La advocación a Sant Martí, el santo preferido de los reyes carolingios, evidencia la antigüedad de la iglesia parroquial de Peralada, confirmada después por las excavaciones arqueológicas, que descubrieron la planta de un pequeño templo pre-románico de principios del siglo IX. Hoy son visibles restos del templo románico, consagrado en 1208, y la torre del campanario del siglo XIV, que testimonia la intención de construir un gran templo gótico que no tuvo éxito.
El edificio actual es de estilo neoclásico, y fue construido a finales del siglo XVIII.
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